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iTRAQ检测样品,技术重复和上机重复有何区别?

2015-03-17 03:37作者:KEECLOUD
【本文导读】一般在得出一个结论,比如itraq实验中差异蛋白,会要求生物学重复和技术重复。生物学重复就是你说的样品重复,用来减少样品来源引起的结论错误,或者可以理解为多次不同取样来验
一般在得出一个结论,比如itraq实验中差异蛋白,会要求生物学重复和技术重复。生物学重复就是你说的样品重复,用来减少样品来源引起的结论错误,或者可以理解为多次不同取样来验证你的结论。技术重复也有人叫实验重复,有统计学上的意义,为了减少实验过程中引入的差异。

iTRAQ实验中,比如,你要比较高转移潜能和低转移潜能的两株肺癌细胞的差异蛋白,不同批次培养的肺癌细胞的样品之间是生物学重复,而同一批次的高低转移潜能肺癌细胞样品等量混合,标记,然后SCX-LC-MS/MS分析做三次,这是技术重复。上机重复是同样的样品,三次LC-MS/MS实验,仅仅是在 质谱分析这一部重复三次。

这些概念源于分析和统计的原理,在一些介绍实验设计之类的文章中会讲到,下面这篇可以参考一下(不过不是iTARQ实验的):

Draghici S., Kuklin A., Hoff B. Shams S. -ExperimentalDesign, Analysis of Variance and Slide Quality Assessment in GeneExpressionArrays, Current Opinion in Drug Discovery & Development, vol. 4,no. 3,2001.
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